Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
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ERCC8Q13216 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
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