Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RESTQ13127 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RESTQ13127 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
RESTQ13127 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RESTQ13127 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
RESTQ13127 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
RESTQ13127 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms