Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
IFT88Q13099 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
IFT88Q13099 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms