Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms