Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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