Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
HOXD13P35453 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
HOXD13P35453 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
HOXD13P35453 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
HOXD13P35453 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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