Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PTPRCP08575 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRCP08575 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRCP08575 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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PTPRCP08575 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRCP08575 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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