Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ANKRD28O15084 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ANKRD28O15084 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ANKRD28O15084 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms