Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HCN3Q9P1Z3 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HCN3Q9P1Z3 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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