Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
SMG1Q96Q15 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMG1Q96Q15 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
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