Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ZBED3Q96IU2 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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