Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FAM3DQ96BQ1 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms