Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CCDC47Q96A33 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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