Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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