Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
AP5B1Q2VPB7 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms