Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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RTL8BQ17RB0 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RTL8BQ17RB0 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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RTL8BQ17RB0 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RTL8BQ17RB0 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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