Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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DDB1Q16531 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
DDB1Q16531 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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