Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
HMGN3Q15651 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
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