Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
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SYCP1Q15431 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SYCP1Q15431 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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