Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HERPUD1Q15011 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms