Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
COL19A1Q14993 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms