Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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CHD4Q14839 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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CHD4Q14839 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHD4Q14839 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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