Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SEMA3AQ14563 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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