Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEDD9Q14511 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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