Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
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