Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GTF2H2Q13888 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.57□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GTF2H2Q13888 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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