Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.46
SPTAN1Q13813 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SPTAN1Q13813 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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