Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
ITGA9Q13797 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
ITGA9Q13797 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ITGA9Q13797 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms