Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CDH18Q13634 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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CDH18Q13634 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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CDH18Q13634 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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CDH18Q13634 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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CDH18Q13634 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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CDH18Q13634 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
CDH18Q13634 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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