Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SMAD4Q13485 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
SMAD4Q13485 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
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