Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
FOXE3Q13461 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
FOXE3Q13461 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
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