Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.2 ms