Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PMS2P3Q13401 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PMS2P3Q13401 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms