Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CTBP1Q13363 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms