Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SP140Q13342 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SP140Q13342 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SP140Q13342 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
SP140Q13342 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
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SP140Q13342 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
SP140Q13342 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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