Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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ERCC8Q13216 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERCC8Q13216 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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