Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
MRPL28Q13084 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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