Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
RBBP4Q09028 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms