Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
FAM3BP58499 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms