Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PGGT1BP53609 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PGGT1BP53609 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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