Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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HOXA13P31271 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXA13P31271 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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