Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRDP23468 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRDP23468 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms