Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
USP18Q9UMW8 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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USP18Q9UMW8 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
USP18Q9UMW8 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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