Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
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LHX9Q9NQ69 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
LHX9Q9NQ69 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
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LHX9Q9NQ69 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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LHX9Q9NQ69 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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LHX9Q9NQ69 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
LHX9Q9NQ69 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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