Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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UHRF1Q96T88 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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UHRF1Q96T88 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
UHRF1Q96T88 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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