Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BCANQ96GW7 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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