Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CSNK2A3Q8NEV1 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
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CSNK2A3Q8NEV1 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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CSNK2A3Q8NEV1 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CSNK2A3Q8NEV1 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CSNK2A3Q8NEV1 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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