Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RTN1Q16799 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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