Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CLPPQ16740 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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