Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SGCBQ16585 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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SGCBQ16585 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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SGCBQ16585 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SGCBQ16585 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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